군수동원총국의 주된 임무는 해당 도, 시, 군, 구역 산하 사유기관을 포함한 일체 공장·기업소에서 생산된 모든 재화를 관리·비축·운용하는 것이다.

북한은 국방성 양식국에서 군사용 비축미를 관리하고, 민군 공용은 군수동원총국에서, 민수용 비축미는 내각 양정부 2호 관리국에서 각각 관리하는 것으로 알려져 있다. 이를 위해 군수동원총국은 각 도에 관리국을 두고 있으며, 관리국은 각 군에 2~3개의 관리소를 두고 있다. 도에 있는 군수동원총국 관리국은 공습이 어려운 산간지대이면서 교통이 용이한 곳에 주로 위치하고 있다.

군수동원총국의 중요 임무 가운데 하나는 4호 물자(전시 소비품과 소비품 원자재) 비축을 위한 지도활동이다. 4호 물자 비축은 군수동원총국이 주관하고, 매년 징수할 4호 물자 계획을 국무위원회 검토를 거쳐 당중앙군사위원회의 명령으로 상업관리소나 공장·기업소에 하달하며, 내각의 각 성·부를 통해 생산된 4호 물자를 징수한다. 군수동원총국은 전시물자 마련을 위해 외화벌이 사업에도 참여하는 것으로 알려졌다.

군사동원국은 국방성 산하 기관으로서, 북한군에 필요한 병력을 징집하는 기관이다. 북한에서는 17세부터 연간 초모계획에 따라 신체검사 및 기초체력 검사 등을 진행하는데, 이를 담당하는 기관이 각 지역의 군사동원부이다. 우리의 병무청 및 지방병무청과 유사한 기능을 하는 기관이라고 이해할 수 있다.